Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Urb2E9Q7L1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Urb2E9Q7L1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Urb2E9Q7L1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Urb2E9Q7L1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Urb2E9Q7L1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Urb2E9Q7L1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Urb2E9Q7L1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Urb2E9Q7L1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms