Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf11E9Q6E5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms