Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip11E9Q512 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms