Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tarbp1E9Q368 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms