Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms