Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms