Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FgaE9PV24 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms