Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28043E0CXC2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28043E0CXC2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28043E0CXC2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28043E0CXC2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28043E0CXC2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28043E0CXC2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28043E0CXC2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28043E0CXC2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28043E0CXC2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28043E0CXC2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms