Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdh8D3Z6W3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rdh8D3Z6W3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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