Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1lD3Z5W0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms