Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Fam46aD3Z5S8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Fam46aD3Z5S8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Fam46aD3Z5S8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fam46aD3Z5S8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fam46aD3Z5S8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fam46aD3Z5S8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fam46aD3Z5S8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fam46aD3Z5S8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam46aD3Z5S8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam46aD3Z5S8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam46aD3Z5S8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam46aD3Z5S8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam46aD3Z5S8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam46aD3Z5S8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam46aD3Z5S8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam46aD3Z5S8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam46aD3Z5S8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam46aD3Z5S8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam46aD3Z5S8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms