Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc6D3YZP9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms