Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif28pD3YXS5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms