Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc13D3YV10 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms