Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia1B2RXQ2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia1B2RXQ2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia1B2RXQ2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia1B2RXQ2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia1B2RXQ2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia1B2RXQ2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia1B2RXQ2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia1B2RXQ2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfia1B2RXQ2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppfia1B2RXQ2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms