Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp26c1B2RXA7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms