Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms