Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms