Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprbB2RU80 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms