Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms