Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms