Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf1bp1B2KF50 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms