Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2012B1B0R1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms