Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Trabd2bB1ATG9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Trabd2bB1ATG9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Trabd2bB1ATG9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Trabd2bB1ATG9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trabd2bB1ATG9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trabd2bB1ATG9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trabd2bB1ATG9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trabd2bB1ATG9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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