Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox1B1APN4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms