Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atp8b5A3FIN4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atp8b5A3FIN4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atp8b5A3FIN4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atp8b5A3FIN4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atp8b5A3FIN4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Atp8b5A3FIN4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Atp8b5A3FIN4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Atp8b5A3FIN4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Atp8b5A3FIN4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Atp8b5A3FIN4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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