Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga8A2ARA8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms