Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rtf1A2AQ19 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms