Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap5A2AGT5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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