Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms