Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms