Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms