Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms