Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pramef6A2A8M8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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