Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PtprfA2A8L5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtprfA2A8L5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtprfA2A8L5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtprfA2A8L5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtprfA2A8L5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PtprfA2A8L5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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PtprfA2A8L5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PtprfA2A8L5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PtprfA2A8L5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PtprfA2A8L5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms