Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms