Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms