Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SQSTM1Q13501 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SQSTM1Q13501 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SQSTM1Q13501 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SQSTM1Q13501 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SQSTM1Q13501 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SQSTM1Q13501 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SQSTM1Q13501 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SQSTM1Q13501 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SQSTM1Q13501 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SQSTM1Q13501 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SQSTM1Q13501 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SQSTM1Q13501 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SQSTM1Q13501 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SQSTM1Q13501 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SQSTM1Q13501 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SQSTM1Q13501 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SQSTM1Q13501 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SQSTM1Q13501 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SQSTM1Q13501 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SQSTM1Q13501 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
SQSTM1Q13501 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 3.2 ms