Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CNTN1Q12860 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CNTN1Q12860 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
CNTN1Q12860 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
CNTN1Q12860 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
CNTN1Q12860 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CNTN1Q12860 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CNTN1Q12860 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CNTN1Q12860 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CNTN1Q12860 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CNTN1Q12860 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
CNTN1Q12860 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
CNTN1Q12860 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CNTN1Q12860 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CNTN1Q12860 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CNTN1Q12860 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CNTN1Q12860 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
CNTN1Q12860 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
CNTN1Q12860 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
CNTN1Q12860 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
CNTN1Q12860 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
CNTN1Q12860 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
CNTN1Q12860 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
CNTN1Q12860 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms