Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
USP49Q70CQ1 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
USP49Q70CQ1 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
USP49Q70CQ1 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
USP49Q70CQ1 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
USP49Q70CQ1 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USP49Q70CQ1 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USP49Q70CQ1 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USP49Q70CQ1 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USP49Q70CQ1 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USP49Q70CQ1 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USP49Q70CQ1 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
USP49Q70CQ1 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
USP49Q70CQ1 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
USP49Q70CQ1 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
USP49Q70CQ1 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
USP49Q70CQ1 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
USP49Q70CQ1 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
USP49Q70CQ1 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
USP49Q70CQ1 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
USP49Q70CQ1 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
USP49Q70CQ1 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
USP49Q70CQ1 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
USP49Q70CQ1 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
USP49Q70CQ1 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
USP49Q70CQ1 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
USP49Q70CQ1 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
USP49Q70CQ1 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
USP49Q70CQ1 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.69□□□□□ -2.68
USP49Q70CQ1 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
USP49Q70CQ1 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
USP49Q70CQ1 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
USP49Q70CQ1 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
USP49Q70CQ1 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USP49Q70CQ1 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USP49Q70CQ1 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
USP49Q70CQ1 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
USP49Q70CQ1 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
USP49Q70CQ1 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
USP49Q70CQ1 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
USP49Q70CQ1 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
USP49Q70CQ1 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
USP49Q70CQ1 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
USP49Q70CQ1 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
USP49Q70CQ1 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
USP49Q70CQ1 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
USP49Q70CQ1 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
USP49Q70CQ1 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
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USP49Q70CQ1 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
USP49Q70CQ1 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
USP49Q70CQ1 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
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USP49Q70CQ1 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
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USP49Q70CQ1 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
USP49Q70CQ1 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
USP49Q70CQ1 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
USP49Q70CQ1 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
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USP49Q70CQ1 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
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USP49Q70CQ1 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
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USP49Q70CQ1 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
USP49Q70CQ1 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
USP49Q70CQ1 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
USP49Q70CQ1 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
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USP49Q70CQ1 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
USP49Q70CQ1 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
USP49Q70CQ1 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
USP49Q70CQ1 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
USP49Q70CQ1 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
USP49Q70CQ1 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
USP49Q70CQ1 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
USP49Q70CQ1 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
USP49Q70CQ1 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
USP49Q70CQ1 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
USP49Q70CQ1 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
USP49Q70CQ1 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
USP49Q70CQ1 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
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