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Protein–RNA interactions for Protein: Q15517
CDSN, Corneodesmosin, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CDSN
Q15517
MIR4770-201
ENST00000579149
58 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CDSN
Q15517
MIR3165-201
ENST00000579874
75 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CDSN
Q15517
MIR4520-1-201
ENST00000582609
70 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CDSN
Q15517
hsa-mir-3607.1-201
ENST00000637229
79 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CDSN
Q15517
RNU6-1340P-201
ENST00000384438
107 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
CDSN
Q15517
MIR5591-201
ENST00000578248
65 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
CDSN
Q15517
SNORD113-3-201
ENST00000364830
72 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
CDSN
Q15517
HLA-S-202
ENST00000425174
53 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
CDSN
Q15517
RNA5SP86-201
ENST00000390869
98 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
CDSN
Q15517
Y_RNA.678-201
ENST00000516408
96 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
CDSN
Q15517
MIR548AM-201
ENST00000584298
74 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
CDSN
Q15517
Y_RNA.103-201
ENST00000363171
102 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
CDSN
Q15517
RNU6-226P-201
ENST00000363778
107 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
CDSN
Q15517
Y_RNA.228-201
ENST00000364346
98 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
CDSN
Q15517
Y_RNA.616-201
ENST00000410835
95 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
CDSN
Q15517
AC097484.2-201
ENST00000509147
251 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
CDSN
Q15517
Y_RNA.475-201
ENST00000384345
101 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
CDSN
Q15517
MIR487B-201
ENST00000385021
84 nt
BASIC
-0.78
□□□□□ -2.53
CDSN
Q15517
MIR1246-201
ENST00000636535
73 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
CDSN
Q15517
Y_RNA.647-201
ENST00000459194
112 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CDSN
Q15517
Y_RNA.640-201
ENST00000459296
112 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CDSN
Q15517
Y_RNA.803-201
ENST00000614432
112 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CDSN
Q15517
Y_RNA.815-201
ENST00000616655
112 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CDSN
Q15517
Y_RNA.795-201
ENST00000619475
112 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CDSN
Q15517
Y_RNA.827-201
ENST00000638104
112 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
CDSN
Q15517
Y_RNA.502-201
ENST00000384478
113 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
CDSN
Q15517
RNU6-983P-201
ENST00000516004
103 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
CDSN
Q15517
SNORD18.1-201
ENST00000363807
70 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
CDSN
Q15517
AC108019.1-201
ENST00000512540
175 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
CDSN
Q15517
Y_RNA.232-201
ENST00000364369
96 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
CDSN
Q15517
Y_RNA.442-201
ENST00000384131
102 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
CDSN
Q15517
MIR4756-201
ENST00000577874
78 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
CDSN
Q15517
MIR664B-201
ENST00000626756
61 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
CDSN
Q15517
CR2-207
ENST00000640301
151 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
CDSN
Q15517
Y_RNA.63-201
ENST00000362841
102 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
CDSN
Q15517
MIR548T-201
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74 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
CDSN
Q15517
Y_RNA.204-201
ENST00000364112
102 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
CDSN
Q15517
Y_RNA.591-201
ENST00000410228
104 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
CDSN
Q15517
Y_RNA.284-201
ENST00000364806
102 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
CDSN
Q15517
RNU6-854P-201
ENST00000364036
107 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
CDSN
Q15517
RNY4P7-201
ENST00000364600
96 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
CDSN
Q15517
Y_RNA.403-201
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101 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
CDSN
Q15517
Y_RNA.543-201
ENST00000384649
107 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
CDSN
Q15517
MIR496-201
ENST00000385226
102 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
CDSN
Q15517
RNU6ATAC32P-201
ENST00000516026
76 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
CDSN
Q15517
MIR4748-201
ENST00000578076
82 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
CDSN
Q15517
Y_RNA.211-201
ENST00000364164
101 nt
BASIC
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□□□□□ -2.56
CDSN
Q15517
RNU6-119P-201
ENST00000364882
107 nt
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-0.95
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CDSN
Q15517
MIRLET7A2-201
ENST00000362105
72 nt
BASIC
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CDSN
Q15517
Y_RNA.501-201
ENST00000384467
103 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
CDSN
Q15517
RNU6-422P-201
ENST00000384632
107 nt
BASIC
-0.96
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CDSN
Q15517
RNU6-118P-201
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102 nt
BASIC
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CDSN
Q15517
RNU6-1247P-201
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98 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
CDSN
Q15517
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114 nt
BASIC
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CDSN
Q15517
RNU6-194P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
CDSN
Q15517
RNU6-1043P-201
ENST00000410355
99 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
CDSN
Q15517
Y_RNA.564-201
ENST00000384708
106 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
CDSN
Q15517
TRAJ33-201
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57 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
CDSN
Q15517
RNY4P9-201
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97 nt
BASIC
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CDSN
Q15517
RNU6-620P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.58
CDSN
Q15517
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ENST00000362525
114 nt
BASIC
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CDSN
Q15517
RNU6-1024P-201
ENST00000384199
107 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
CDSN
Q15517
Y_RNA.225-201
ENST00000364326
97 nt
BASIC
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□□□□□ -2.58
CDSN
Q15517
Y_RNA.421-201
ENST00000384052
101 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
CDSN
Q15517
MIR3139-201
ENST00000579145
76 nt
BASIC
-1.08
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CDSN
Q15517
VTRNA2-1-201
ENST00000602301
127 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
CDSN
Q15517
RNU6-737P-201
ENST00000365370
107 nt
BASIC
-1.09
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CDSN
Q15517
TARS-215
ENST00000626210
201 nt
TSL 5
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
CDSN
Q15517
RNY4-201
ENST00000516507
96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.59
CDSN
Q15517
SNX3P1Y-201
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176 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
CDSN
Q15517
AL731768.1-201
ENST00000603124
139 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
CDSN
Q15517
Y_RNA.513-201
ENST00000384522
100 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
CDSN
Q15517
RNU6-1306P-201
ENST00000365219
99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.59
CDSN
Q15517
MT-TM-201
ENST00000387377
68 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
CDSN
Q15517
Y_RNA.59-201
ENST00000362828
102 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
CDSN
Q15517
RNU6-1277P-201
ENST00000364561
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.6
CDSN
Q15517
SNORD54-201
ENST00000459159
67 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
CDSN
Q15517
RNU6-627P-201
ENST00000364032
102 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
CDSN
Q15517
Y_RNA.53-201
ENST00000362765
102 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
CDSN
Q15517
MIR124-1-201
ENST00000385275
85 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
CDSN
Q15517
MIRLET7A3-201
ENST00000362116
74 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
CDSN
Q15517
Y_RNA.612-201
ENST00000410717
95 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
CDSN
Q15517
AL359920.1-201
ENST00000618332
176 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
CDSN
Q15517
RNY4P25-201
ENST00000459254
96 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
CDSN
Q15517
Y_RNA.663-201
ENST00000516043
101 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
CDSN
Q15517
RNU6-1161P-201
ENST00000516176
102 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
CDSN
Q15517
Y_RNA.137-201
ENST00000363455
112 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
CDSN
Q15517
Y_RNA.397-201
ENST00000383950
98 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
CDSN
Q15517
MIR5693-201
ENST00000577722
73 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
CDSN
Q15517
Y_RNA.652-201
ENST00000458902
102 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
CDSN
Q15517
RNU6-230P-201
ENST00000362457
104 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
CDSN
Q15517
Y_RNA.830-201
ENST00000628531
96 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
CDSN
Q15517
Y_RNA.79-201
ENST00000362992
113 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
CDSN
Q15517
Y_RNA.266-201
ENST00000364678
96 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
CDSN
Q15517
SNORD114-13-201
ENST00000364377
74 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
CDSN
Q15517
SNORD115-45-201
ENST00000391078
81 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
CDSN
Q15517
MIR548AH-201
ENST00000637109
76 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
CDSN
Q15517
hsa-mir-550a-2.1-201
ENST00000637473
97 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
CDSN
Q15517
RNU6-1044P-201
ENST00000384755
107 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
CDSN
Q15517
RNU6-1191P-201
ENST00000516799
107 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
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