Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SEC23AQ15436 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SEC23AQ15436 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SEC23AQ15436 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SEC23AQ15436 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SEC23AQ15436 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.45□□□□□ -2.64
SEC23AQ15436 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SEC23AQ15436 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SEC23AQ15436 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SEC23AQ15436 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SEC23AQ15436 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SEC23AQ15436 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SEC23AQ15436 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SEC23AQ15436 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SEC23AQ15436 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SEC23AQ15436 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SEC23AQ15436 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SEC23AQ15436 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SEC23AQ15436 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SEC23AQ15436 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SEC23AQ15436 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SEC23AQ15436 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SEC23AQ15436 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SEC23AQ15436 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SEC23AQ15436 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SEC23AQ15436 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
SEC23AQ15436 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SEC23AQ15436 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SEC23AQ15436 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SEC23AQ15436 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SEC23AQ15436 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SEC23AQ15436 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SEC23AQ15436 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SEC23AQ15436 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SEC23AQ15436 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SEC23AQ15436 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SEC23AQ15436 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SEC23AQ15436 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SEC23AQ15436 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SEC23AQ15436 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SEC23AQ15436 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SEC23AQ15436 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SEC23AQ15436 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SEC23AQ15436 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SEC23AQ15436 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SEC23AQ15436 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SEC23AQ15436 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SEC23AQ15436 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SEC23AQ15436 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SEC23AQ15436 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SEC23AQ15436 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SEC23AQ15436 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SEC23AQ15436 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SEC23AQ15436 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SEC23AQ15436 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SEC23AQ15436 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SEC23AQ15436 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SEC23AQ15436 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SEC23AQ15436 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SEC23AQ15436 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SEC23AQ15436 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SEC23AQ15436 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SEC23AQ15436 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SEC23AQ15436 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SEC23AQ15436 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SEC23AQ15436 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SEC23AQ15436 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SEC23AQ15436 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SEC23AQ15436 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SEC23AQ15436 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.4 ms