Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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