Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ALYREFQ86V81 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALYREFQ86V81 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALYREFQ86V81 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALYREFQ86V81 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALYREFQ86V81 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALYREFQ86V81 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ALYREFQ86V81 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ALYREFQ86V81 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ALYREFQ86V81 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ALYREFQ86V81 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ALYREFQ86V81 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ALYREFQ86V81 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ALYREFQ86V81 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALYREFQ86V81 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALYREFQ86V81 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALYREFQ86V81 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALYREFQ86V81 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ALYREFQ86V81 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ALYREFQ86V81 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ALYREFQ86V81 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ALYREFQ86V81 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALYREFQ86V81 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ALYREFQ86V81 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ALYREFQ86V81 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ALYREFQ86V81 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ALYREFQ86V81 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ALYREFQ86V81 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ALYREFQ86V81 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ALYREFQ86V81 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ALYREFQ86V81 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALYREFQ86V81 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALYREFQ86V81 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALYREFQ86V81 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALYREFQ86V81 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ALYREFQ86V81 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALYREFQ86V81 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALYREFQ86V81 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALYREFQ86V81 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALYREFQ86V81 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALYREFQ86V81 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALYREFQ86V81 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ALYREFQ86V81 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ALYREFQ86V81 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ALYREFQ86V81 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ALYREFQ86V81 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ALYREFQ86V81 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ALYREFQ86V81 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ALYREFQ86V81 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ALYREFQ86V81 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms