Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATG3Q9NT62 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATG3Q9NT62 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATG3Q9NT62 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATG3Q9NT62 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATG3Q9NT62 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATG3Q9NT62 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATG3Q9NT62 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATG3Q9NT62 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATG3Q9NT62 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATG3Q9NT62 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATG3Q9NT62 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATG3Q9NT62 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATG3Q9NT62 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATG3Q9NT62 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATG3Q9NT62 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATG3Q9NT62 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATG3Q9NT62 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATG3Q9NT62 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATG3Q9NT62 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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ATG3Q9NT62 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATG3Q9NT62 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATG3Q9NT62 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATG3Q9NT62 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATG3Q9NT62 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATG3Q9NT62 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATG3Q9NT62 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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ATG3Q9NT62 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ATG3Q9NT62 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
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ATG3Q9NT62 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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ATG3Q9NT62 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATG3Q9NT62 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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ATG3Q9NT62 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATG3Q9NT62 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATG3Q9NT62 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATG3Q9NT62 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATG3Q9NT62 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATG3Q9NT62 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATG3Q9NT62 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATG3Q9NT62 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ATG3Q9NT62 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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