Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SEH1LQ96EE3 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SEH1LQ96EE3 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SEH1LQ96EE3 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SEH1LQ96EE3 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SEH1LQ96EE3 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SEH1LQ96EE3 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
SEH1LQ96EE3 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SEH1LQ96EE3 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SEH1LQ96EE3 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SEH1LQ96EE3 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SEH1LQ96EE3 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SEH1LQ96EE3 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SEH1LQ96EE3 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
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