Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USP43Q70EL4 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.9 ms