Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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USP43Q70EL4 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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USP43Q70EL4 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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USP43Q70EL4 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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USP43Q70EL4 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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USP43Q70EL4 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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USP43Q70EL4 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USP43Q70EL4 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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USP43Q70EL4 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
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USP43Q70EL4 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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USP43Q70EL4 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USP43Q70EL4 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
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