Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRERF1Q96PN7 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRERF1Q96PN7 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRERF1Q96PN7 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRERF1Q96PN7 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRERF1Q96PN7 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRERF1Q96PN7 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TRERF1Q96PN7 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRERF1Q96PN7 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRERF1Q96PN7 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRERF1Q96PN7 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRERF1Q96PN7 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRERF1Q96PN7 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRERF1Q96PN7 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRERF1Q96PN7 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRERF1Q96PN7 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
TRERF1Q96PN7 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRERF1Q96PN7 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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TRERF1Q96PN7 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRERF1Q96PN7 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRERF1Q96PN7 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRERF1Q96PN7 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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