Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
IRF3Q14653 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
IRF3Q14653 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
IRF3Q14653 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
IRF3Q14653 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
IRF3Q14653 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
IRF3Q14653 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
IRF3Q14653 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
IRF3Q14653 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
IRF3Q14653 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
IRF3Q14653 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
IRF3Q14653 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
IRF3Q14653 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
IRF3Q14653 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
IRF3Q14653 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
IRF3Q14653 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
IRF3Q14653 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
IRF3Q14653 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
IRF3Q14653 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
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