Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MKRN3Q13064 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MKRN3Q13064 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MKRN3Q13064 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MKRN3Q13064 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MKRN3Q13064 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
MKRN3Q13064 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MKRN3Q13064 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MKRN3Q13064 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MKRN3Q13064 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MKRN3Q13064 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MKRN3Q13064 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MKRN3Q13064 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MKRN3Q13064 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MKRN3Q13064 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MKRN3Q13064 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MKRN3Q13064 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MKRN3Q13064 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MKRN3Q13064 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MKRN3Q13064 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MKRN3Q13064 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MKRN3Q13064 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MKRN3Q13064 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MKRN3Q13064 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MKRN3Q13064 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MKRN3Q13064 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MKRN3Q13064 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MKRN3Q13064 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MKRN3Q13064 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MKRN3Q13064 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
MKRN3Q13064 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MKRN3Q13064 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
MKRN3Q13064 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MKRN3Q13064 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MKRN3Q13064 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MKRN3Q13064 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MKRN3Q13064 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MKRN3Q13064 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MKRN3Q13064 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MKRN3Q13064 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MKRN3Q13064 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MKRN3Q13064 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MKRN3Q13064 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MKRN3Q13064 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MKRN3Q13064 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MKRN3Q13064 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MKRN3Q13064 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MKRN3Q13064 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MKRN3Q13064 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MKRN3Q13064 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MKRN3Q13064 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MKRN3Q13064 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MKRN3Q13064 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MKRN3Q13064 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MKRN3Q13064 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MKRN3Q13064 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MKRN3Q13064 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MKRN3Q13064 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MKRN3Q13064 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MKRN3Q13064 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MKRN3Q13064 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MKRN3Q13064 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MKRN3Q13064 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MKRN3Q13064 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MKRN3Q13064 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MKRN3Q13064 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MKRN3Q13064 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MKRN3Q13064 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MKRN3Q13064 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MKRN3Q13064 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MKRN3Q13064 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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